| 1996 (平成8) |
2月 | 舞子墓園で駅伝大会（中高） |  駅伝大会 |
| 10月 | 総長チーム来校（震災見舞） | ||
| 11月 | 新校舎へ夢をつないでリサイクルガラスでレンガを |  新校舎に夢をつないで |
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| 12月 | 垂水養護学校と交流会（中3・以後恒例） | ||
| 1997 (平成9) |
3月 | 新しい講堂にて高校第33回、中学第36回卒業式 新校舎祝別式 |
 中高新校舎 |
| 4月 | 新校舎で高校第36回、中学第39回入学式 | ||
| 5月 | 新校舎、体育館、講堂、聖堂竣工式 イエスの聖心の像新体育館東側に設置 |
 聖堂竣工式 |
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| 8月 | 卓球部、近畿カトリック学校競技大会優勝 | ||
| 10月 | 高校修学旅行 初の沖縄行き (平成12年まで） 私たちの暮らしとエネルギー作文コンクール 資源エネルギー庁長官賞受賞（小） |
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| 1998 (平成10) |
8月 | 新体操部全国中学校総体出場（以後平成16年まで7年連続出場） 手紙作文コンクール 手紙作文部門 郵政大臣賞受賞（小） |
 全国中学校総体出場 |
| 1999 (平成11) |
サイエンスクラブ第42回全国学芸科学コンクール入賞（中） | ||
| 3月 | 明石海峡大橋を歩いて渡るイベントに参加（小） ゴミを減らす工夫作文コンクール 環境庁賞受賞（小） |
 明石海峡大橋を歩いて渡る |
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| 2000 (平成12) |
手紙作文コンクール郵政大臣賞（中） | ||
| 5月 | マナー学習開始 総合的な学習の一環として「わくわく野菜ランド」を作る（小） |
 わくわく野菜ランドにて |
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| 2001 (平成13) |
5月 | バトミントン部創部（中高） 「朝の読書」開始（中高） |
 朝の読書 |
| 7月 | 学園広報のホームページ立ち上げ | ||
| 9月 | 学芸発表会、最後の全校合唱（中高） 情報教室整備（中高） 私学連合音楽会に出演（小） 動物愛護の作文コンクール 環境大臣賞・日本動物福祉・協会一等賞受賞（小） |
 情報教室 |
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| 2002 (平成14) |
2月 | 「研究紀要」を「愛徳教育」と改称（第23号） | |
| 4月 | 「総合的な学習の時間」開始（中） | ||
| 6月 | 新体操部高校総体近畿大会出場 | ||
| 2003 (平成15) |
6月 | 新体操部高校総体近畿大会出場 | |
| 2004 (平成16) |
2月 | スキー教室開始（初年度のみ5、6年生参加）（小） | |
| 3月 | 新体操部全国高校選抜大会出場 | ||
| 6月 | 新体操部高校総体近畿大会出場 |
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